电视动画《棋魂》改编自同名漫画《小田由美》Studio Pierrot2001年10月10日至2003年3月26日，东京电视台系列负责动画制作，分为两集，共75集。    2004年1月3日，日本播出特别篇章OVA《棋魂Special：香港于2005年3月首播，2006年4月重播北斗杯之路。动画不涉及中北斗杯三国对战的故事，只指日本北斗杯预选赛。    2021年9月3日，Studio Pierrot宣布《棋魂》动画开播20周年企画相关情报将于10月陆续公布。

进藤光是一名小学六年级的学生。有一天，小光跑到爷爷家寻宝，想赚点零花钱。没想到，他不小心翻出了一个旧棋盘。就在他接触棋盘的那一刻，他看到了安全时代的天才棋手——藤原佐为。佐为把围棋当成了生命。在佐为的恳求下，小光带他去围棋俱乐部下棋。在围棋俱乐部，佐为因为不能触及实物，只能口述棋子的行列，让小光下棋。在那里，光第一次下棋就遇到了已经达到专业棋手的塔矢亮。佐为为塔矢下了一盘指导棋，第一局获胜，佐为和塔矢亮后来下了第二盘棋，佐为正式与塔矢下了一盘棋，第二局佐为获胜。在接下来的日子里，塔矢亮不断追求小光的目标。塔矢不知道佐为是真正下棋的。在佐为的影响下，小光也向往围棋。在一场围棋比赛中，小光和塔矢亮下了半盘棋，清楚地了解了自己与塔矢的距离，也开始以塔矢亮为目标，不敢让小光意识到网上不借助塔矢亮下棋。SAI以下棋的名义。SAI许多其他国家的棋手在网上被打败，    一度成为围棋界的风云人物，在不久的国际围棋比赛中，棋手们因为三谷的话而纷纷讨论SAI是谁？塔矢亮在网吧找到了小光，以为网上下棋了SAI是进藤光，不幸的是，我只在电脑上看到了漫画页面。塔矢亮后，小光了解到SAI已经成为一个风云人物，佐为不能再在网上下棋了。为了追逐塔矢的脚步，小光成为了一名大四学生。小光和佐为整天下棋，棋艺日夜成长。佐为也发现自己在这个世界上已经很久了。他害怕，他想下更多的棋。他不想承认小光棋艺高强，也不想承认他能教小光。最后一次，他恳求和小光下棋，但小光认为佐为任性。一天早上，佐为恳求和小光下棋。这盘棋是最后一盘棋，佐为还没下完就消失了。佐为消失后，小光去了棋院，去了秀策的故居，只是为了寻找佐为的足迹，却找不到。从那以后，小光抑郁了一段时间，不愿意面对围棋。在朋友的帮助下，小光从围棋中感受到佐为的存在，对围棋充满热情。在一个梦里，小光看到了佐为，佐为似乎想说什么，但他终于松了一口气，把折扇给了小光。